Más allá de las bacterias
Cuando la gente dice "microbioma", casi siempre se refiere a bacterias. Sin embargo, el intestino alberga una comunidad diversa de hongos — el micobioma — que comprende aproximadamente el 0,1 por ciento de la biomasa microbiana total pero ejerce una influencia biológica que va mucho más allá de su tamaño.
Los actores principales
Candida albicans: el hongo intestinal más estudiado. En baja abundancia, es un comensal. El sobrecrecimiento ocurre cuando la competencia bacteriana se reduce (por antibióticos) o la inmunidad se compromete. Saccharomyces cerevisiae: levadura del pan y la cerveza, también encontrada como comensal intestinal. S. boulardii (una cepa de S. cerevisiae) es el probiótico fúngico mejor estudiado. Malassezia: principalmente un hongo cutáneo, pero encontrado también en el intestino, donde puede contribuir a la inflamación en la enfermedad de Crohn.
Interacciones hongos-bacterias
Los hongos y las bacterias no existen de forma aislada. Las bacterias producen ácidos grasos de cadena corta y ácidos biliares secundarios que inhiben el crecimiento fúngico. Los antibacterianos que eliminan estas bacterias crean espacio ecológico para la expansión de Candida. Los antifúngicos pueden alterar recíprocamente las comunidades bacterianas.
El micobioma y la inmunidad
El sistema inmunitario reconoce los hongos a través de receptores de lectina tipo C (Dectin-1, Dectin-2) que detectan los beta-glucanos de la pared fúngica. La desregulación de esta vigilancia contribuye a la enfermedad de Crohn, donde los anticuerpos anti-Saccharomyces cerevisiae (ASCA) son un marcador diagnóstico.
El viroma: más allá incluso de los hongos
El intestino también contiene billones de bacteriófagos — virus que infectan y matan bacterias — que moldean la estructura de la comunidad bacteriana. El viroma añade otra capa de complejidad a la ecología del microbioma.